Şehzade Mustafa'nın ölümü Osmanlı tarihinde herkes için bir merak konusudur. Kanuni'nin en büyük oğlu olmasına rağmen Kanuni tarafından boğdurulması, ölümü ardından çıkan iç karışıklık bir çok insanın merakını celbetmektedir. Şehzade Mustafa'nın ölümünün öncesinde Kanuni İran seferi için hazırlık yapmaktaydı. Ancak savaşa kendisi yerine Rüstem paşa'yı göndermiş, askerler bu durumdan rahatsız olmuş ve ordu İstanbul'dan öteye gidememiştir. Bu durumda da Rüstem Paşa İstanbul'a geri dönmek zorunda kalmıştır. Askerler padişahın yaşlandığını o sebeple ordunun başına geçmediğini düşünmüş, hatta "Padişahımız kocadı bize lazım civanı" diyerek Şehzade Mustafa'yı padişah olarak görmek istediklerini söylemişlerdir. Bu durumun ardından Kanuni Süleyman ordunun başına geçmiş, orduyla birlikte Konya Ereğlisi'ne harekete geçmiştir. Rüstem Paşa, Anadolu'da ordu toplarken Şehzade Mustafa'nın bir kalkışmaya hazırlandığına dair bilgiyi Kanuni'ye iletince çözümü oğlunu boğdurtmakta bulmuştur. Şehzade Mustafa da 5000 donanımlı birliği ile Konya'ya geldi ve babasını Otağı Hümayun'da ziyaret etmeye karar verdi. Askerler her ne kadar uyarsa da silahını bırakarak içeri giren Şehzade Mustafa içerde 7 dilsiz cellat tarafından saldırıya uğradı ve can verdi. Kendisini İran ile işbirliği yaptığını sembolize etmek amacıyla İran halısına sarılıp askerlerin önünde cansız bedeni sergilendi.
Bunun üzerine öfkelenen ordugah ilk gün matem sebebiyle öğlen yemeği yemedi, sonrasında Rüstem Paşa'yı hedef aldı ve burada Rüstem Paşa'yı öldürmeye çalıştılar. Kanuni öfkenin Rüstem Paşa'da odaklandığını gördüğü için ilk olarak Rüstem Paşa'yı görevden aldı. Sonrasında da Rüstem Paşa apartopar İstanbul'a dönmek zorunda kaldı.
Sonrasında gelişen olayları ve Şehzade Mustafa'nın türbesini aşağıdaki videodan izleyebilirsiniz;